Nem tudom.
Sose volt iOS eszközöm (ha rajtam múlik, nem is lesz), de azt tudom, hogy tele a net ezzel a kérdéssel, és számtalanszor belefutottam már.
Erős a gyanúm, hogy a két mentés egymástól független, de konzisztens, azaz az egyiket is, meg a másikat is vissza lehet állítani, és nem tudnak egymásról.
De az is lehet, hogy a szervereken valahol annyi tárolva van, hogy milyen klienst használt legutóbb.
Tényleg nem tudom.
Azt viszont szinte biztosra veszem, hogy ha van egy pc-s kliens is egy gépen, azon a beszélgetések "folytonosak" lesznek. Bár... jobban belegondolva a fene tudja...