Szia! Tiszta szerencséd van én pont el akarom mondani valakinek a játék amúgy nagyon is bonyolult történetét. Legalábbis a főbb szálait, ugyanis összetett és szövevényes cselekményszálakból áll, van ami nekem is tisztázatlan maradt, és külföldi fórumokon hosszas komment háború, és értekezés folyik arról, hogy tulajdonképpen mi a fene is ez az egész? 
SPOILER! SPOILER! SPOILER! SPOILER! SPOILER! SPOILER!
Bookert két titokzatos esőkabátos megbízó Columbiába küldi, hogy megszerezze Elizabethet, adja oda nekik, és ezzel eltörölheti az adósságát. Columbiában a próféta, vezéralak, Comstock, aki többek közt megjósolja egy "hamis pásztor" érkezését, kinek kezén egy A.D. monogram található, és aki majd eljön Elizabethért a város jövőjéért, hogy elvigye tőlük. Ez a személy maga DeWitt a főszereplőnk. Elizabeth megszerzése érdekében segíti őt egy furcsa ikerpár. ( Itt az elején Telegrammot küldenek neki, hogy ne fogadjon a 77-es számra, amit persze megtesz.) Ezen ikerpár női tagja az aki felel a város lebegéséért. Kvantummechanika a titka... Ugyanezen Lutece ikerpár felelős egy gép megépítéséért, amely képes kapukat nyitni egy másik dimenzióba. Comstock lánya, Elizabeth az, akin kísérleteznek ők, ezáltal képessé teszik a lányt is kapuk megnyitására más dimenziókba. Ezek a dimenziók bármilyenek lehetnek, Columbia változatai, de Elizabeth csak korlátozva tutdja használni képességét, mert az angyalban melyben él van egy gép, amely korlátozza. Így csak kapukat képes nyitni létező dimenziókba, de nem képes őket átlátni és nem tudja elhagyni Columbiát. (Ezért is építették az eszközt, hogy ne tudja elhagyni.) Az ikerpár egyébként a dimenziókkal való kísérletezés közben meghal, ennek folyományaként, létezővé válnak az összes dimenzióban és minden idősíkban, így képesek mindenhol előbukkanni. 
Na az a helyzet, hogy Booker a múltban megbánta a sok gyilkosságot amit katonaként követett el. (Katonai
éveiről Columbiában is tud egy hadi parancsnok) Ezért, hogy bűnei alól feloldhassa magát egy keresztény
közösségben meg akarja keresztelni magát. A történet szerint itt két dimenzió jön létre. Egy, amelyben megkersztelkedik, és egy amelyben végül visszautasítja a eresztelést. A megkeresztelt Booker mit csinált?
átneveztette magát COMSTOCK-á és megalapította Columbiát. 
Míg a másik dimenzióban lévő Bookernek, aki végül megtagadta a keresztelkedést, született egy lánya. Anna DeWitt. (a monogramm Booker kezén.) Élték az életüket külön dimenziókban, ám Comstocknak időközben kellett egy utód. Egy örökös, hiszen öregedett. Viszont nem volt képes gyerek nemzésére. Így a Lutece ikrek gépét használta, hogy egy másik dimenzióból szerezzen magának gyereket. A sajátját, aki vér szerint is a sajátja, hiszen
attól a Bookertől veszi el, aki ő maga egy másik dimenzióban. Ő lesz Annából Elizabeth. Sok-sok dimenzió
van, amelyben Comstock mindenképpen megszerzi Bookertől a lányt, a dolog egy dimenzióban sem végződik másként.
Booker, akitől a gyereket elvették (eladta, nekik, hogy adósságát törlesszthesse, de hamar megbánta a dolgot, csak már késő volt) kap egy esélyt a Lutece ikerktől akik dimenziót nyitnak neki, hogy viszont lássa
a lányát. Ám mikor Booker átmegy a kapunk, elveszti az emlékeit, és újjakat kreál a régiekből. Kitalálja, hogy neki a lányt az adósság törlesztése okán kell megszereznie. Az ikrek ráhagyják. (Egyébként az ikrek igazából ugyanannak az egy személynek a két különböző dimenzióbeli megtestesülése)
A történet végén, mikor megsemmisítik az eszközt, mely korlátozza Elizabeth képességeit, a lány rájön, hogy Booker és Anna egyik dimenzióban sem lehetnek együtt Comstock miatt, ezért Booker azt tanácsolja öljék meg Comstockot, mikor született. Ez akkor történt, mikor Booker választás elé került a keresztelkedés
ügyében. Ide jönnek, itt jön rá Booker, a végén, hogy ő maga Comstock és hagyja hogy a különböző dimenziókból jövő Elizabethek megfullasszák.
Nos ez a lényeg. A többit én nem igazán..tudom.
