Ok, megvan.
A két kártya berakása után le kell pucolni az összes ATI-s szoftvert, restart, legújabb driver fel, restart, legújabb driver még egyszer, restart, és menni fog.
Azért nem látta a BOINC a másikat, mert csak egyszer tettem fel a vga drivert, és csak az egyikhez rakta fel azt. A másik a windows-ba építettel ment. Kétszer kell feltenni ugyanazt a drivert.